國家發(fā)改委在2006年公布的一個材料顯示，學(xué)生奶計劃在產(chǎn)品供應(yīng)方面出現(xiàn)了良莠不齊的現(xiàn)象，有些地方甚至將蛋白質(zhì)含量僅1%的含乳飲料作為學(xué)生奶供應(yīng)。近年來，“蛋奶工程”屢屢出現(xiàn)食品安全問題。專家分析稱，利潤微薄導(dǎo)致企業(yè)缺乏安全生產(chǎn)動力。